-年，治京口；-年，治广陵；-年，治盱眙；-年，治广陵。
沿革
永初元年（年），省南青、并州并入南兖州。
元嘉八年（年）六月己卯，始割江淮间为境，治广陵。（江北为南兖州，江南为南徐州）
元嘉八年（年）八月丁未，割豫州秦郡属南兖州。
元嘉二十八（年）年，南兖州徙治盱眙。
元嘉三十年（年）正月，省南兖州并入南徐州；六月，复立，还治广陵。
大明五年（年），以东平郡并入广陵郡。又侨立新平、北淮阳、北济阴、北下邳、东莞五郡。
泰始七年（年）四月甲辰，于南兖州置新平郡。
泰始七年（年）十二月丁酉，分豫州、南兖州立南豫州。
元徽元年（年）十月癸酉，割南兖州之钟离、豫州之马头，又分秦郡、梁郡、历阳置新昌郡，立徐州。
南兖州刺史
檀道济（-年）
刘义欣（-年）
刘遵考（年）
刘义宣（-年）
刘义恭（-年）
刘义庆（-年）
刘义宗（年）
刘诞（年）
刘义季（-年）
刘义宾（-年）
徐湛之（-年）
刘浚（-年）（南徐、南兖二州刺史）
刘骏（年）
刘义恭（-年）
沈庆之（-年）
刘延孙（年）
檀和之（-年）
刘子尚（年）
刘休仁（-年）
刘诞（-年）
沈庆之（-年）
刘子勋（-年）
刘子仁（-年）
刘祗（年）
刘休范（年）（南徐、南兖二州刺史）
张永（年）
刘景素（年）
沈攸之（-年）
刘韫（年）
萧道成（-年）
沈怀明（-年）
张永（年）
萧道成（-年）
李安民（-年）
黄回（年）
萧映（-年）
兖州-，-年，治滑台；-年，寄治彭城；-年，治瑕丘；-年，寄治淮阴。
沿革
刘裕平河南，于滑台置兖州。
元嘉十三年（年），治邹山，又寄治彭城。
元嘉二十年（年），省兖州，分郡属徐、冀州。（此处疑为元嘉三十年，无实据。）
元嘉三十年（年）六月复立，治瑕丘。
大明元年（年）八月戊戌，于兖州立阳平郡。
宋末（泰始二年，年）失淮北，侨立兖州，寄治淮阴。
兖州刺史
徐琰（年）
竺灵秀（年）
郑顺之（年）
申宣（年）
徐遵之（-年）
王懿（王仲德）（-年）（徐、兖二州刺史）
王方俳（-年）
刘遵考（年）（徐、兖二州刺史）
赵伯符（-年）（徐、兖二州刺史）
臧质（-年）
徐琼（-年）
刘骏（-年）（徐、兖二州刺史）
萧思话（-年，年）（徐、兖二州刺史）
徐遗宝（-年）
夏侯祖欢（夏侯祖权）（年）
申坦（-年）（徐、兖二州刺史）
垣阆（年）
《宋书·》（孝武帝纪、垣护之传、刘诞传）皆作兖州刺史，有观点认为，垣阆此时应为南兖州刺史，其可能据刘诞传“……上将诛诞，以义兴太守垣阆为兖州刺史，配以羽林禁兵，遣给事中戴明宝随阆袭诞，使阆以之镇为名。阆至广陵，诞未悟也。……”此段中“以之镇为名”推出，但垣阆之镇兖州路过广陵亦在合理范围内。今从宋书。
夏侯祖欢（夏侯祖权）（-年）
沈僧荣（-年）
薛安都（年）
殷孝祖（-年）
申纂（年）
毕众敬（年）
王整（-年）
崔平（年）
周宁民（年）
刘休宾（-年）
崔公烈（年）
李灵谦（年）
孟次阳（年，年，年）（本纪载三次为兖州）
吕安国（-年）
《宋书》本纪，记载为元徽二年为兖州刺史。《南齐书》吕安国传，记载为元徽三年。应是三年方到任。
李灵谦（-年）
垣崇祖（-年）